要解答，还是要回到原著，而且不能做过度的引申。
首先，根据原著，孙悟空的授业恩师是菩提祖师。这个名字很有意思。菩提是佛教用语，本身就是一个音译词，菩提在梵文当中的本意就是智慧，因为佛陀在菩提树下成道，所以这种树才被称为菩提树。意思就是智慧之树。而根据原著以及整个称号后面的祖师，又表明他是一个道士。显然杂糅了佛道两家。单纯从名字方面得到的信息也只有这么多，很难再进一步分析。
其次，西游记作者是否有意暗示了菩提祖师的具体身份？从原著本身来看是不存在的。而且在原著当中，菩提祖师在孙悟空学成之后就要求他离开，并且不允许他向别人透露自己的身份。同时在原著当中也没有第2次出现。电视剧西游记当中，孙悟空在偷吃人参果之后，推翻了人参果树，因此被镇元大仙困住。后来他向镇元大仙提出自己会找人来医治此树。之后就一度前往菩提祖师处寻求帮助，但是发现原来的宫观已经毁坏。这个情节是编剧增加的，原著当中并没有。不能用这个情节来推定菩提祖师的身份。
再次，现在的很多所谓的西游记解读，都存在过度发挥的现象，并不符合原著。有人认为，菩提祖师实际上就是如来佛祖或者观世音的化身。他们教导孙悟空的目的就是为了促成之后的大闹天宫。然后再由其出面镇压孙悟空。在这个过程当中完成佛教和道教之间的一次合作，从而为佛教传入东土大唐做一个准备。在经历500年镇压之后，磨平了孙悟空的心性，让他成为唐僧西行路上的保镖，最后完成佛教东传大业。这是一个高度宿命论的观点。认为从孙悟空出生开始，这一切都是被如来和观音所控制的。实际上，按照书中的说法，孙悟空本身就是一个从石头缝中蹦出来的时候，而这块石头之所以能够沾染仙气，恰恰是因为观世音在外出的时候，到这块石头上歇息。也就是说从孙悟空的出生到大闹天宫到最后被镇压，然后成为唐僧的保镖，名义上的徒弟，都是从一开始就设计好的一个局。我认为，这恰恰违背了作者的本意。西游记本身就是一个戏谑宗教的作品，不可能站在佛教的立场上来解读。因为作者本身就有否定佛教的倾向。如果按照这种设计，作者应该是一个虔诚的佛教徒。
最后，对于菩提祖师的解读，还是应该把它放回到小说创作本身来分析。西游记不是一个完全原创的作品。而是一个历经传承积累创造，最后在明代中期定本的一个文学作品。孙悟空的艺术形象，要比现在的小说西游记早大约600年左右的历史。小说西游记的作者在创作的时候，大体上沿用了从唐代晚期就开始逐步成形的故事基本构架。那么在这种情况下，他实际上需要做一件事情就是让整个故事情节更为合理。早期取经故事当中，往往侧重于唐僧，换句话说，以唐僧取经作为起点。不过西游记则不同，将第一主角从唐僧改成了孙悟空。因此就有必要完整交代孙悟空的身世。在这个过程当中，必须要介绍孙悟空神通的来历。那么就需要为孙悟空安排一个师父。而这个师父，实际上不适合任何一个已知的神仙来担任。所以，作者杜撰了一个菩提祖师的人物。而这个人物，又是一个兼具佛道两家色彩的人物。这是一个很精明的设计。一方面，暗示了孙悟空虽然出身道门，最终却要归于释门。另一方面，也体现了作者兼通佛道两家文化的特点。实际上，在小说当中此类杜撰并非唯一。唐僧的前世身份是佛祖的二徒弟金蝉子。但实际上没有任何一本佛经当中记载过，佛陀曾经有这样一位弟子。而作者本身也没有意图对这个人物进一步发挥，所以在让菩提祖师教授玩孙悟空神通之后，在其后的小说当中便不再出现。所以，作者塑造这个人物的主要目的是为了让情节更完整，合理。而不是为了其后埋下伏笔。纠结于这个人物的名字本身，做各种无根据的发挥，实际上没有必要。
我们知道，西游记里孙悟空的恩师就是菩提老祖，但西游记里却没有过多的介绍他。
这里我们不防看一下在西游记里最厉害的三位大神，西方天尊～如来佛祖，仙界大神～菩提老祖，地仙之祖～镇远大仙。虽然原始天尊提到过，但原著里却没有介绍他的能耐，这个我们先排开。
这三位是西游记里着重介绍过的，也是唯一把孙悟空收拾的没脾气的人，如来，直接把孙悟空压在的五行山下，菩提老祖，孙悟空的师傅，孙悟空的本事都是他教的。镇元子，孙悟空打倒了他的人生果树，他把唐僧抓去了，孙悟空一点办法也没有。
综合这些，，我们大概可以分析出菩提老祖和如来佛祖的关系了，在西游记里，他们应该是同一个辈分的，在上古时代或是同门师兄弟，又或是一起修炼的道友，但如来佛祖排名应该在菩提老祖前面，因为三界之事只有他知晓的最多，五行之内也只有他算的更远。法力也应该是如来更胜一筹，但却又是谁拿谁也没有办法的那种关系。
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